Theo đề xuất, danh mục bệnh truyền nhiễm trong Chương trình Tiêm chủng mở rộng gồm 13 bệnh: viêm gan virus B, lao, bạch hầu, ho gà, uốn ván, bại liệt, Haemophilus influenzae tuýp b, sởi, viêm não Nhật Bản B, rubella, tiêu chảy do virus Rota, phế cầu, ung thư cổ tử cung.
Ngoài ra, Bộ Y tế cũng đề xuất danh mục 10 bệnh truyền nhiễm mà đối tượng có nguy cơ cao tại vùng dịch hoặc đến vùng dịch bắt buộc phải tiêm vắc-xin, gồm bạch hầu, bại liệt, ho gà, rubella, sởi, tả, viêm não Nhật Bản B, dại, cúm và Covid-19.
Việc xác định đối tượng tiêm vaccine do Sở Y tế trình UBND tỉnh, thành phố quyết định hoặc theo chỉ đạo từ Bộ Y tế dựa trên tình hình dịch bệnh và khả năng cung ứng vaccine.
Về phạm vi bắt buộc, vaccine trong danh mục này sẽ được triển khai toàn quốc cho trẻ em và phụ nữ mang thai trong Chương trình Tiêm chủng mở rộng.
Riêng vaccine phòng bệnh do phế cầu và ung thư cổ tử cung sẽ được triển khai theo lộ trình tăng số lượng vaccine giai đoạn 2021-2030 và khả năng tài chính của trung ương, địa phương.