Báo cáo giải trình, tiếp thu, chỉnh lý dự luật Ủy ban Thường vụ Quốc hội cho hay nhiều ý kiến không tán thành quy định đổi mới tòa án cấp tỉnh thành tòa án nhân dân phúc thẩm, tòa án cấp huyện thành tòa án nhân dân sơ thẩm.
Một số ý kiến đề nghị thí điểm tổ chức tòa án theo thẩm quyền xét xử tại một số địa phương.
Nhiều ý kiến tán thành dự thảo luật về đổi mới tòa án theo thẩm quyền xét xử và đề nghị quy định cụ thể các vấn đề liên quan (như quan hệ giữa tòa án với cấp ủy đảng, chính quyền địa phương...).

Thường vụ Quốc hội nhận thấy việc đổi tòa án cấp tỉnh thành tòa án phúc thẩm, tòa án cấp huyện thành tòa án sơ thẩm nhưng nhiệm vụ, quyền hạn của các tòa án không thay đổi.
Các tòa án vẫn gắn với đơn vị hành chính huyện, tỉnh. Tòa án phúc thẩm vẫn xét xử, giải quyết theo thủ tục sơ thẩm một số vụ án, vụ việc.
Quy định như dự luật chưa đáp ứng chủ trương nghị quyết 27, không thống nhất về tổ chức của các cơ quan tư pháp khác ở địa phương.
Mặt khác, phải sửa đổi nhiều luật có liên quan, nhất là các luật trong lĩnh vực tư pháp để bảo đảm tính thống nhất của hệ thống pháp luật, đồng thời phát sinh nhiều chi phí khác như sửa con dấu, biển hiệu, các loại biểu mẫu, giấy tờ...
Tiếp thu ý kiến đại biểu, Ủy ban Thường vụ Quốc hội đề nghị Quốc hội cho giữ nguyên quy định của luật hiện hành về tòa án tỉnh, huyện.